個人投資兩個以上個人獨資企業(yè)的所得稅的繳納
　　個人投資兩個以上個人獨資企業(yè)的所得，年終需合并匯總計算所得稅，再按照各自生產(chǎn)經(jīng)營所得的比例為每個獨資企業(yè)分配計征所得稅。
　　國家稅務(wù)總局《關(guān)于〈關(guān)于個人獨資企業(yè)和合伙企業(yè)投資者征收個人所得稅的規(guī)定〉執(zhí)行口徑的通知》(國稅函[2001]第84號)第一條規(guī)定：“投資者興辦兩個或兩個以上企業(yè)，并且企業(yè)性質(zhì)全部是獨資的，年度終了后匯算清繳時，應(yīng)納稅款的計算按以下方法進(jìn)行：匯總其投資興辦的所有企業(yè)的經(jīng)營所得作為應(yīng)納稅所得額，以此確定適用稅率，計算出全年經(jīng)營所得的應(yīng)納稅額，再根據(jù)每個企業(yè)的經(jīng)營所得占所有企業(yè)經(jīng)營所得的比例，分別計算出每個企業(yè)的應(yīng)納稅額和應(yīng)補(bǔ)繳稅額。計算公式如下：應(yīng)納稅所得額=Σ各個企業(yè)的經(jīng)營所得;應(yīng)納稅額=應(yīng)納稅所得額×稅率-速算扣除數(shù);本企業(yè)應(yīng)納稅額=應(yīng)納稅額×本企業(yè)的經(jīng)營所得/Σ各個企業(yè)的經(jīng)營所得;本企業(yè)應(yīng)補(bǔ)繳的稅額=本企業(yè)應(yīng)納稅額-本企業(yè)預(yù)繳的稅額。”
　　例如，李先生投資經(jīng)營了一家生產(chǎn)性個人獨資企業(yè)。2014年生產(chǎn)經(jīng)營所得是8萬元，已累計預(yù)繳個人所得稅2萬元;2014年年初，李先生又投資了一家水果超市(個人獨資企業(yè))，2014年經(jīng)營所得是12萬元，已累計預(yù)繳個人所得稅3萬元。
　　林先生在年終匯算清繳時，應(yīng)納稅所得額=8+12=20(萬元)，以此確定稅率及速算扣除數(shù)計算應(yīng)納稅額=200 000×35%-14 750=55 250(元);生產(chǎn)性企業(yè)應(yīng)納稅額=55 250×80 000÷200 000=22 100(元);應(yīng)補(bǔ)繳稅款=22 100-20 000=2 100(元);水果超市應(yīng)納稅額=55 250×120 000÷200 000=33 150(元);應(yīng)補(bǔ)繳稅款=33 150-30 000=3 150(元)。

　　個人獨資企業(yè)匯算后提取經(jīng)營所得不再繳個稅
　　財政部、國家稅務(wù)總局《關(guān)于印發(fā)〈關(guān)于個人獨資企業(yè)和合伙企業(yè)投資者征收個人所得稅的規(guī)定〉的通知》(財稅[2000]91號，以下簡稱財稅[2000]91號)附件1：《關(guān)于個人獨資企業(yè)和合伙企業(yè)投資者征收個人所得稅的規(guī)定》第四條規(guī)定：“個人獨資企業(yè)和合伙企業(yè)(以下簡稱企業(yè))每一納稅年度的收入總額減除成本、費用以及損失后的余額，作為投資者個人的生產(chǎn)經(jīng)營所得，比照個人所得稅法的‘個體工商戶的生產(chǎn)經(jīng)營所得’應(yīng)稅項目，適用5%～35%的五級超額累進(jìn)稅率，計算征收個人所得稅。”前款所稱收入總額，是指企業(yè)從事生產(chǎn)經(jīng)營以及與生產(chǎn)經(jīng)營有關(guān)的活動所取得的各項收入，包括商品(產(chǎn)品)銷售收入、營運收入、勞務(wù)服務(wù)收入、工程價款收入、財產(chǎn)出租或轉(zhuǎn)讓收入、利息收入、其他業(yè)務(wù)收入和營業(yè)外收入。第五條規(guī)定：“個人獨資企業(yè)的投資者以全部生產(chǎn)經(jīng)營所得為應(yīng)納稅所得額;合伙企業(yè)的投資者按照合伙企業(yè)的全部生產(chǎn)經(jīng)營所得和合伙協(xié)議約定的分配比例確定應(yīng)納稅所得額，合伙協(xié)議沒有約定分配比例的，以全部生產(chǎn)經(jīng)營所得和合伙人數(shù)量平均計算每個投資者的應(yīng)納稅所得額。前款所稱生產(chǎn)經(jīng)營所得，包括企業(yè)分配給投資者個人的所得和企業(yè)當(dāng)年留存的所得(利潤)。”
　　例如，張先生是一家個人獨資企業(yè)的投資者，其個人獨資企業(yè)個人所得稅實行查賬征收，完成2014度匯算清繳后，取得稅后所得為25萬元。近期張先生打算從中提取一筆款項用于個人消費，那提取稅后利潤是否還需要申報繳納“利息、股息、紅利所得”項目的個人所得稅?根據(jù)財稅[2000]91號的規(guī)定，由于個人獨資企業(yè)投資者生產(chǎn)經(jīng)營所得的個人所得稅已經(jīng)按照“個體工商戶生產(chǎn)經(jīng)營所得”項目計征了投資者的個人所得稅，因此個人獨資企業(yè)分配稅后利潤不需要再繳納個人所得稅。

　　個人獨資和合伙企業(yè)取得的“四業(yè)”所得暫不征個稅
　　財政部、國家稅務(wù)總局《關(guān)于個人獨資企業(yè)和合伙企業(yè)投資者取得種植業(yè)養(yǎng)殖業(yè)飼養(yǎng)業(yè)捕撈業(yè)所得有關(guān)個人所得稅問題的批復(fù)》(財稅[2010]96號)規(guī)定：“對個人獨資企業(yè)和合伙企業(yè)從事種植業(yè)、養(yǎng)殖業(yè)、飼養(yǎng)業(yè)和捕撈業(yè)(簡稱‘四業(yè)’)，其投資者取得的“四業(yè)”所得暫不征收個人所得稅。”
　　基于此規(guī)定，從事種植業(yè)、養(yǎng)殖業(yè)、飼養(yǎng)業(yè)和捕撈業(yè)的個人獨資企業(yè)和合伙企業(yè)的投資者取得的所得暫不征收個人所得稅。